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wangyufeng的博客

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集群投递任务注意事项  

2013-08-01 19:19:14|  分类: Linux学习 |  标签: |举报 |字号 订阅

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qselect –U [username]   检验用户可使用的队列及节点

example:

qselect –U xxx

正常投递命令

qsub #用户投递sge任务命令

-cwd #指定当前工作路径作为output-dir

-S #指定远程计算节点的shell路径

-l #指定资源请求,多个请求用逗号(,)隔开

    h=compute-1-1 #指定任务跑在某个具体的节点

    vf=5G  #消耗内存总量的最大值

    p=4 #指定cpu核数

-q #指定到具体的队列

-P #指定到工作项目组

example:

qsub -cwd -l vf=1G 03.cut.scaffold.sh

查看状态

qstat

example:

    qstat -j 9788656

    qstat –u yanzengli

删除任务

qdel

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