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RUM 1.11 – Comparative Analysis of RNA-Seq Alignment Algorithms and the RNA-Seq Unified Mapper  

2012-06-15 10:43:49|  分类: 生物信息分析 |  标签: |举报 |字号 订阅

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:: DESCRIPTION

RUM (RNA-Seq Unified Mapper)  is an alignment, junction calling, and feature quantification pipeline specifically designed for Illumina RNA-Seq data.

::DEVELOPER

the Computational Biology and Informatics Laboratory (in the Center for Bioinformatics at the University of Pennsylvania)

:: SCREENSHOTS

N/A

:: REQUIREMENTS

:: DOWNLOAD

 RUM

:: MORE INFORMATION

Citation:

Gregory R. Grant, Michael H. Farkas, Angel Pizarro, Nicholas Lahens, Jonathan Schug, Brian Brunk, Christian J. Stoeckert Jr, John B. Hogenesch and Eric A. Pierce.
Comparative Analysis of RNA-Seq Alignment Algorithms and the RNA-Seq Unified Mapper (RUM)
Bioinformatics. 2011 Sep 15;27(18):2518-28. Epub 2011 Jul 19.

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