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MEME:Motif-based sequence analysis tools  

2012-04-11 10:07:34|  分类: 生物信息分析 |  标签: |举报 |字号 订阅

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MEME:Motif-based sequence analysis tools - 喜欢吃桃子 - wangyufeng的博客
 

The MEME Suite allows you to:

  • discover motifs using MEME, DREME (DNA only) or GLAM2 on groups of related DNA or protein sequences,
  • search sequence databases with motifs using MAST, FIMO, MCAST or GLAM2SCAN,
  • compare a motif to all motifs in a database of motifs,
  • associate motifs with Gene Ontology terms via their putative target genes, and
  • analyse motif enrichment using SpaMo or CentriMo.

To submit a query, click on one of the logos below or select "Submit A Job" from the menu at the left.


MEME Logo MAST Logo TOMTOM Logo
GOMO Logo GLAM2 Logo GLAM2SCAN Logo
FIMO Logo MCAST Logo MEMECHiP Logo
SpaMo Logo DREME Logo CentriMo Logo    

Maintenance and development of the MEME Suite is funded by the National Center for Research Resources grant NIH/NCRR R01 RR021692. The MEME Suite web server is funded by the National Biomedical Computation Resource.

via:http://meme.sdsc.edu/meme/intro.html
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