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使用ImageJ软件分析电泳条带  

2012-01-09 17:01:12|  分类: DNA实验基础 |  标签: |举报 |字号 订阅

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    ImageJ由美国National Institute of Mental Health 的研究员Wayne Rasband (wayne@codon.nih.gov)所写,是一个功能强大的免费软件。
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 download:http://rsb.info.nih.gov/ij/download.html
ImageJ这套软件可以自动帮你你计算细胞数,也可以定量分析DNA电泳或是Western blot条带。
step 1.首先打开软件后,开启图档
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step 2.请先做校正,选择Analyze底下的Calibrate选项,再选择校正的模式,使用Uncalibrate OD,再按ok 
  按下ok之后会出现校正的图形
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 Step 3.在要分析的第一条(first lane)加上一个长型框(工具列第一个选项),再按下Analyze/Gels/select first Lane快速键(Ctr+1),此时框架中会出现一个号码1,之后可以移动框架到第二个lane再选择Analyze/Gels/select second Lane快速键(Ctr+2),当然可以一直加下去,最后按Analyze/Gels/plot Lanes快速键(Ctr +3)。
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 Step 4.分析以后会出现图型表示你刚选择的框内的影像强度,此时可以看到有几个比较高的区段,就是我们想定量的band,使用直线工具(工具列第五个选项)先 将图形中高点为有band的区域和没有band的区域分开再,使用魔术棒工具(工具列第八个选项)点选要分析的区域。
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 Step 5.当我们点选分析时,在result的对话视窗会出现分析的数据,依序点选就会出现每个band的值。
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 注:当我们选择分析的条带也可以是横向选取,就可以只比较相同大小的DNA的含量,同样也可以应用在western blot或其它类似实验条带的分析上。
以上内容转来:http://ggene.cn/html/protocol/ruanjianjiaocheng/2009/0421/284.html
 
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