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应用突变体进行基因的精细定位与应用QTL定位的区别  

2011-07-06 21:44:41|  分类: 数量遗传学 |  标签: |举报 |字号 订阅

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    利用突变体进行基因的精细定位与应用QTL的定位本质上是一样的。所不同之处在于:突变体你可以很容易的将表型分成野生型和突变型两类,也就是0和1的关系,因为往往突变就是一个基因变异造成的。QTL 定位用的是正常材料(相对突变体材料)构建的遗传群体,控制你想要研究性状的基因通常为多个,而这些基因在亲本中可能表现为不同的等位基因形式,所以在分 离群体中就有不同的组合方式,如假设某种性状由5个基因ABCDE控制,亲本一中这五个基因为ABCDE,而亲本二中这五个基因为AbcDe,故在分离后 代中会出现BbCcEe,BBCcEe,bbCcee等等多种基因型的个体,因而会出现不同等级的表型,和突变体不一样,这些表型不能用是和非,0和1来 表现,而是呈现1234567的关系。之所以突变体可以很快定位,因为能将表型简单区分,而表型就可推知基因型。进而你可以将两种表型的植株bulk,看性状和哪个标记连锁,实现初定。QTL定位的时候,不能简单的根据表型来推知基因型(因为多基因控制,而非单基因),所以要获得每个单株(或者line)的基因型和表型来进行联合分析,定位QTL。其实两者的基本原理是一样的,说白了就是孟德尔的遗传学三大定律。QTL没有任何神秘的,就是通过统计手段,捕获或者说推演出控制目标性状的一系列的单基因。由于是根据统计的方法得出的,就存在假阳性和基因丢失的风险。当精细定位一个QTL的时候,就和利用突变体定位基因一样了。因为在fine mapping QTL的分离群体中(高代回交构建的NIL),就单个基因在分离。
本文转自:http://bbs.biogo.net/simple/?t168272.html

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