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wangyufeng的博客

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日志

 
 

如何使用压缩文件直接进行Blast  

2011-12-10 16:22:35|  分类: 生物信息分析 |  标签: |举报 |字号 订阅

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        目前几乎所有的测序结果文件都是压缩格式,比如GZIP or ZIP格式。在unix平台下,使用下面的命令行就可以直接进行blast分析。
$ gzip -dc file.fasta.gz | blastall -i stdin -p blastn -d database ...
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